Des de la seva fundació, l'IQS ha mantingut una sòlida vinculació amb institucions universitàries europees.

Ja el seu fundador, el P.Vitòria, va cursar els seus estudis de Doctorat en la Universitat de Lovaina i va ser deixeble de Grignard.

Posteriorment, professors del IQS han mantingut relacions científiques amb Universitats i Centres d'Investigació de tota Europa i han estat nombrosos els professors i científics que han realitzat estades en el nostre centre.

En els últims anys, el IQS ha participat activament en la incorporació en programes europeus com els de mobilitat (Sócrates/Erasmus), de reconeixement d'estudis realitzats en universitats estrangeres (European Credit Transfer System, ECTS), de pràctiques en empreses (Leonardo) i de col·laboració amb països de l'Est (Tempus), entre uns altres.